Gentoo linux默认分区方案，如下：
分区的数目主要根据你的系统环境来决定。
例如，如果有很多用户，可能更希望把/home目录独立出来，因为这样做可以增加安全性，备份起来也更容易。
如果安装Gentoo用来做邮件服务器，你的/var目录应该独立出来，因为邮件都存储在/var目录中。
选择一个好的文件系统将最大限度地提高你的系统性能。游戏服务器应该把/opt目录独立出来，因为大多数游戏服务端软件都安装在那。
理由也与/home目录类似：安全与备份。
一定要使/usr 目录保持足够大：因为它将不仅包含大部分应用程序，而且Portage树本身就需要大约500M空间，这还不包括存储在其中的各种源代码包。
独立的分区或卷有以下优点：
可以为每一个分区或卷选择最佳性能的文件系统
如果一个有问题的工具不停地向一个分区或卷写文件，也不会把你整个系统的可用空间都用完
如果需要，可以减少文件系统检测的时间，因为多个检测可以并行的进行（尽管这个优势在多磁盘系统上比多分区系统上更为明显）
通过对一些分区的进行只读、nosuid（忽略setuid位）、noexec（忽略可执行位）等方式挂载，安全性会大大增强。
然而，多分区系统有一大缺点：如果配置的不合理，可能导致系统中一个分区有很大的空闲空间，而另一个没有空闲空间了。SCSI和SATA还有15个分区的限制。
作为分区的例子，以一个有20GB磁盘的笔记本（包含网站服务器、邮件服务器、gnome……）为例，df命令查看：
（留作它用的未分配空间：2GB）
这里的/usr快满了（使用了83%），但是一旦所有的软件都安装好了，/usr目录就不会如此的增长了。
尽管分配给/var目录的空间看似过多了，但是要记住，Portage默认使用这个分区来编译软件包。
如果想要/var目录保持一个合理的大小，如1GB，需要更改/etc/make.conf 文件中的PORTAGE_TMPDIR来指定一个拥有足够的空闲空间的分区，用以编译诸如OpenOffice这样巨大的软件包。