php提供了system(),exec(),passthru()这几个函数来调用外部的命令.
区别:
system() 输出并返回最后一行shell结果。
exec() 不输出结果，返回最后一行shell结果，所有结果可以保存到一个返回的数组里面。
passthru() 只调用命令，把命令的运行结果原样地直接输出到标准输出设备上。
相同点：都可以获得命令执行的状态码
在php中调用外部命令，可以用如下三种方法来实现：
1） 用php提供的专门函数
php提供共了3个专门的执行外部命令的函数：system()，exec()，passthru()。
system()
原型：string system (string command [, int return_var])
system()函数很其它语言中的差不多，它执行给定的命令，输出和返回结果。第二个参数是可选的，用来得到命令执行后的状态码。
例子：
exec()
原型：string exec (string command [, string array [, int return_var]])
exec ()函数与system()类似，也执行给定的命令，但不输出结果，而是返回结果的最后一行。虽然它只返回命令结果的最后一行，但用第二个参数array 可以得到完整的结果，方法是把结果逐行追加到array的结尾处。所以如果array不是空的，在调用之前最好用unset()最它清掉。只有指定了第二 个参数时，才可以用第三个参数，用来取得命令执行的状态码。
例子：
passthru()
原型：void passthru (string command [, int return_var])
passthru ()只调用命令，不返回任何结果，但把命令的运行结果原样地直接输出到标准输出设备上。所以passthru()函数经常用来调用象pbmplus （unix下的一个处理图片的工具，输出二进制的原始图片的流）这样的程序。同样它也可以得到命令执行的状态码。
例子：
2） 用popen()函数打开进程
上面的方法只能简单地执行命令，却不能与命令交互。但有些时候必须向命令输入一些东西，如在增加linux的系统用户时，要调用su来把当前用户换到root才行，而su命令必须要在命令行上输入root的密码。这种情况下，用上面提到的方法显然是不行的。
popen ()函数打开一个进程管道来执行给定的命令，返回一个文件句柄。既然返回的是一个文件句柄，那么就可以对它读和写了。在php3中，对这种句柄只能做单一 的操作模式，要么写，要么读；从php4开始，可以同时读和写了。除非这个句柄是以一种模式（读或写）打开的，否则必须调用pclose()函数来关闭 它。
例子1：
例子2
3） 用反撇号（`，也就是键盘上esc键下面的那个，和~在同一个上面）
这个方法以前没有归入php的文档，是作为一个秘技存在的。方法很简单，用两个反撇号把要执行的命令括起来作为一个表达式，这个表达式的值就是命令执行的结果。
例如：
这个脚本的输出：
hunte.gif
hunte.ppm
jpg.htm
jpg.jpg
passthru.php
要考虑些什么？
要考虑两个问题：安全性和超时。
先 看安全性。比如，你有一家小型的网上商店，所以可以出售的产品列表放在一个文件中。你编写了一个有表单的html文件，让你的用户输入他们的email地 址，然后把这个产品列表发给他们。假设你没有使用php的mail()函数（或者从未听说过），你就调用linux/unix系统的mail程序来发送这 个文件。程序就象这样：
system("mail $to < products.txt");
echo "我们的产品目录已经发送到你的信箱：$to";
用这段代码，一般的用户不会产生什么危险，但实际上存在着非常大的安全漏洞。如果有个恶意的用户输入了这样一个email地址：
那么这条命令最终变成：
无论哪个网络管理人员见到这样的命令，都会吓出一身冷汗来。
php提供了两个函数：escapeshellcmd()和escapeshellarg()。函数escapeshellcmd把一个字符串 中所有可能瞒过shell而去执行另外一个命令的字符转义。这些字符在shell中是有特殊含义的，象分号（），重定向（>）和从文件读入 （<）等。函数escapeshellarg是用来处理命令的参数的。
它在给定的字符串两边加上单引号，并把字符串中的单引号转义，这样这个字符串 就可以安全地作为命令的参数。
超时问题。如果要执行的命令要花费很长的时间，那么应该把这个命令放到系统的后台去运 行。
但在默认情况下，象system()等函数要等到这个命令运行完才返回（实际上是要等命令的输出结果），这肯定会引起php脚本的超时。
解决办法：
把命令的输出重定向到另外一个文件或流中。
例如：